Dissertation/Thesis Abstract

Phylogeographic Insights into Zika Virus in Puerto Rico
by Kalinich, Chaney C., M.P.H., Yale University, 2020, 28; 27962199
Abstract (Summary)

Durante la epidemia del virus de Zika (ZIKV) en las Américas, Puerto Rico sufrió el impacto entre Noviembre 2015 y Diciembre 2016. La cifra de casos en Puerto Rico fue de 39,717 personas residentes (1.1% del población). Nuestro equipo secuenció 84 genomas de ZIKV directamente de muestras clínicas confirmadas por PCR positivas. Estas muestras son representativas del periodo completo de la epidemia y de distintas regiones de la isla. El objetivo de este estudio fue describir el marco de transmisión del ZIKV en la isla, reconstruyendo las introducciones y dispersión. Nuestros hallazgos indican que ZIKV estuvo circulando en las Antillas Mayores en Abril (95% IC: Febrero–Junio) de 2015, y fue introducido a Puerto Rico en Agosto (95% IC: Julio–Noviembre) de 2015. Aunque se describen varias introducciones, solo dos demostraron transmisión continua y un linaje incluye 77% de nuestros genomas. Regiones de las zonas costeras, especialmente la costa noreste, tienen introducciones tempranas y pueden ser las fuentes de extensión a otras regiones de la isla. La dispersión del virus en la isla estuvo altamente correlacionada con la incidencia en el origen, pero no con el volumen de viajes. Esta epidemia es parte de una tendencia en crecimiento en el surgimiento de enfermedades arbovirales teniendo un gran impacto en las Américas y el Caribe en particular. Este evento subraya la importancia de realizar estudios comprensivos sobre las dinámica de transmisión de arbovirus en Puerto Rico y describir factores que promuevan la extensión arboviral de forma endémica y epidémica.

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Indexing (document details)
Advisor: Grubaugh, Nathan D.
Commitee: Cohen, Ted
School: Yale University
Department: School of Public Health
School Location: United States -- Connecticut
Source: MAI 81/12(E), Masters Abstracts International
Source Type: DISSERTATION
Subjects: Epidemiology, Genetics, Bioinformatics
Keywords: Epidemiology of microbial diseases, Phylogenetics, Public health modeling, Puerto Rico, Sequencing, Zika virus
Publication Number: 27962199
ISBN: 9798641293226
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